Chủ đề nóng: Phương pháp kỷ luật tích cực - Cổ học tinh hoa - Những thói hư tật xấu của người Việt - Công lý: Việc đúng nên làm - Giáo án Điện tử - Sách giáo khoa - Học tiếng Anh - Bài giảng trực tuyến - Món ăn bài thuốc - Chăm sóc bà bầu - Môi trường - Tiết kiệm điện - Nhi khoa - Ung thư - Tác hại của thuốc lá - Các kỹ thuật dạy học tích cực
- Dạy học phát triển năng lực - Chương trình giáo dục phổ thông
Thành viên:Cao Xuân Hiếu/Note: Protocol tách protein từ inclusion bodies trong điều kiện biến tính
Từ VLOS
Thông thường khi sản xuất lượng lớn protein ngoại sinh trong tế bào E.coli thì những protein này được xuất vào những thể đặc có màng vững chắc (inclusion bodies, IBs) ngay cả khi siêu âm. Để tách nhanh, sạch và hiệu quả protein trong IBs trong điều kiện biến tính có thể tiến hành như sau:
- Thu tế bào bằng ly tâm 8000rpm trong 10 phút, 4°C
- (Có thể) Rửa tế bào 1 lần bằng PBS nếu thu lượng lớn (hơn 200 mL dịch nuôi cấy)
- Hòa (resuspension) tế bào trong đệm tách với tỷ lệ 10 OD unit/mL. Thành phần đệm: 50 mM TEA, 250 mM sucrose, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, DNase 20 μg/mL, 1mM PMSF
- Siêu âm phá tế bào 30s x 5 lần (output = 2, duty = 60% đối với <500 μl dịch). Lưu 20 μl dịch để điện di kiểm tra (5 μl ~ 0.05 OD unit)
- Ly tâm thấp 6.000 rpm trong 10 phút, 4°C. Lưu 20 μl dịch nổi để điện di kiểm tra (5 μl ~ 0.05 OD unit)
- (Có thể) Ly tâm phần dịch nổi còn lại 13.000 rpm trong 20 phút, 4°C. Điện di kiểm tra phần dịch nổi (5 μl ~ 0.05 OD unit) và cặn (hòa với Sol Mix 2x tỷ lệ 0.01 OD unit /μl
- Hòa cặn từ ly tâm thấp (bước 5) trong đệm Tris-HCl 20 mM, pH=8.0 với tỷ lệ 0.1 OD unit/μl. Lưu 5 μl để điện di kiểm tra.
- Trộn dịch hòa cặn còn lại với 10V (10 lần thể tích) dung dịch rửa 1: Tris-HCl 20 mM, pH 8.0; 500 mM NaCl; 2% Triton X-100; 2 M Urea, lắc kỹ trong 15 phút tại 37°C
- Siêu âm phá màng 10s x 3 lần (output = 2, duty = 60% đối với <500 μl dịch).
- Ly tâm 6.000 rpm trong 10 phút, 4°C. Lưu dịch nổi để điện di kiểm tra (5 μl ~ 0.05 OD unit)
- Làm tan cặn trong đệm Tris-HCl 20 mM, pH=8.0 với tỷ lệ 0.1 OD unit/μl. Lưu 5 μl để điện di kiểm tra.
- Rửa cặn 2 lần bằng dung dịch rửa 2: Tris-HCl 20 mM, pH 8.0; 500 mM NaCl; 2 M Urea, lắc mạnh và ly tâm 6.000 rpm trong 10 phút, 4°C. Lưu dịch nổi để điện di kiểm tra (5 μl ~ 0.05 OD unit)
- Làm tan cặn sau khi rửa trong đệm Tris-HCl 20 mM, pH=8.0 với tỷ lệ 0.1 OD unit/μl. Lưu 5 μl để điện di kiểm tra.
- Trộn dịch hòa cặn còn lại với 10V (10 lần thể tích) dung dịch tách: Tris-HCl 20 mM, pH 8.0; 500 mM NaCl; 2 M Urea; 1mM ß-mercaptoethanol (5 mM Imidazole nếu sau đó muốn tinh sạch bằng cột His-tag), lắc kỹ trong 60 phút tại 37°C
- Ly tâm 13.000 rpm trong 10 phút, 20°C. Dịch nổi sẽ chứa protein quan tâm. Điện di kiểm tra (5 μl ~ 0.05 OD unit)
- Làm tan cặn với Sol Mix 2x với tỷ lệ 0.01 OD unit /μl. Điện di 0.05 OD unit để kiểm tra
- (Có thể) Các phân đoạn dịch nổi và cặn ở bước 10, 11, 12, 13 có thể cần tủa protein bằng 50% Acentone, 20% TCA để kết quả điện di không bị ảnh hưởng bởi Triton X-100.
Liên kết ngoài[sửa]
- Preparation of Denatured Protein Samples from Inclusion Bodies, Cold Spring Harbor Protocols
- Quality control of inclusion bodies in Escherichia coli Microb Cell Fact. 2010 May 28;9:41.
Bài cùng thể loại[sửa]
- Kỹ thuật PCR căn bản
- Làm sạch nhanh sản phẩm PCR để giải trình tự
- Lựa chọn hệ biểu hiện để sản xuất protein ở vi khuẩn