Xác định cấu trúc protein bằng kỹ thuật khối phổ
Các nhà khoa học đã dùng kỹ thuật khối phổ cải tiến để xác định cấu trúc một protein tín hiệu có vai trò quan trọng trong quá trình sinh lý ở một số bệnh phổ biến như bệnh tiểu đường và ung thư.
Protein Epac2 (exchange protein directly activated by cAMP 2 - protein trao đổi được hoạt hóa trực tiếp bằng cAMP 2) là một yếu tố trao đổi nucleotide guanine, có khả năng điều hòa rất nhiều quá trình nội bào trong sự tương tác với hợp chất truyền tín hiệu thứ cấp cAMP (cyclic adenosine monophosphate).
Một dự án hợp tác được thực hiện bởi các nhà nghiên cứu ở Đại học Y Texas (University of Texas Medical Branch) và Đại học California (University of California) sử dụng kỹ thuật khối phổ trao đổi hydrogen/deuterium (DXMS) để xác định cấu trúc ba chiều của Epac2 khi có và không có mặt cAMP.
Kết quả nghiên cứu được đưa trên tạp chí Biological Chemistry cho biết cAMP có hai vùng liên kết để tương tác với Epac2 theo kiểu phù hợp trình tự và làm thay đổi cấu dạng của Epac2 theo một cách rất đặc thù. Sự thay đổi cấu dạng này do một chuyển động khớp nối tập trung ở đầu C của vùng gắn thứ hai trên cAMP. Sự thay đổi hình dạng này sắp xếp lại các thành phần điều hòa của Epac2 nằm cách xa trung tâm hoạt động xúc tác, tạo điều kiện cho việc gắn nối các yếu tố khác.
“Nghiên cứu này sử dụng một phương pháp phân tích cấu trúc protein mạnh mẽ để xác định cách thức một tín hiệu hóa học được gọi là cAMP bật một trong những “công tắc” protein của nó là Epac2”, Ts.Xiaodong Cheng ở Đại học Y Texas cho biết.
“DXMS đã chứng minh nó là một phương pháp hiệu quả đến kinh ngạc, sử dụng riêng hoặc kết hợp với kỹ thuật khác để phát hiện cách thức protein làm việc như những “chiếc máy” phân tử, thay đổi cấu dạng theo chức năng cụ thể của chúng,” Gs. Virgil Woods của Đại học California nói. “Đây là công cụ tuyệt vời để xác định và phát triển các liệu pháp thuốc điều trị hướng vào sự dịch chuyển của các protein này.”
