Thảo luận:Lecture:Phân loại học phân tử/Tasks/3

Từ Thư viện Khoa học VLOS
Bước tới: chuyển hướng, tìm kiếm

Hic, có vẻ hơi ngớ ngẩn một tí, nhưng các anh có thể giải thích giúp em ý nghĩa của việc bắt cặp trình tự và xóa bỏ các trình tự không đồng bộ được không ạ?

Lê Thị Trang, 22:38, 6/5/2011 (UTC)

Tôi đã chạy được toàn bộ khối dữ liệu (350 seq của 16S Bộ Rùa) đó mất 7 tiếng trên máy Pentium Dual-Core T4300 @ 2.1 GHz với 4GB RAM. Lưu ý:

  1. nên chia nhỏ khối dữ liệu và align nó với trình tự khởi điểm.
  2. Lưu ý 1 số trình tự ko đúng chiều, phải reverse complement lại trên BioEdit
  3. Cắt các đoạn trình tự thừa trong từng khối nhỏ
  4. Sau này gộp các khối nhỏ lại và chạy 1 lần cuối
Cao Xuân Hiếu, 05:46, 15/4/2011 (UTC)