Thành viên:Cao Xuân Hiếu/Note: Nấm giống cây hơn hay giống động vật?

Cây sinh loài này được dựng từ một ngân hàng dữ liệu của 5,279 nhóm protein tương đồng từ proteome của 17 loài sinh vật nhân thực như tên đã ghi. Cây này được dựng gốc dựa vào 159 nhóm protein có đại diện trong proteome của 6 loài vi khuẩn cổ. Thuật toán dùng để dựng cây và mô phỏng quá trình tiến hóa là hợp lý cực đại Maximum likehood. Chiều dài tương đối của các nhánh được gán với đơn vị Darwins (trong đó 1 Darwin = 1/2,000 khoảng cách tiến hóa giữa người (human) và nấm men (S. cerevisiae). Danh pháp của các loài cụ thể không được ghi trên hình là Plasmodium falciparum (ký sinh trùng sốt rét, malaria parasite), Chlamydomonas reinhardtii (tảo lục, green alga), Oryza sativa (lúa, rice), Zea mays (ngô, maize), Takifugu rubripes (cá ,fish) và Anopheles gambiae (muỗi, mosquito). Nguồn hình từ công trình trên tạp chí Nature

Nguyễn Hiếu Nghĩa đang làm một bài tiểu luận nhỏ về đề tài sau: - Giới nấm gần giới thực vật hay động vật, tại sao người ta tách giới nấm ra khỏi giới thực vật? Sử dụng kiến thức về bộ gen của giới nấm.

Tôi thấy chủ đề có thể chuyển thành câu hỏi sau: 1) Genome của nấm gần với genome của thực vật hơn hay genome của động vật hơn? Hoặc là 2) khoảng cách di truyền giữa các gene (cây phát sinh loài) của nấm gần với gene tương ứng trên thực vật hay động vật hơn.

Đây có lẽ là 1 bài toán thú vị cho bạn nào muốn thử sức thư giãn trí não (brain storming). Hãy thử vạch ra 1 chiến lược để giải bài toán trên.

<comments/>

Liên kết hữu ích

• Saccharomyces Genome Database và wiki của nó