Thảo luận Thành viên:Phạm Thạch Thảo/Note: Tìm hiểu về sự bất ổn của hệ nhiễm sắc thể trong tế bào ung thư
Còn vấn đề nữa em không đọc được từ genome, trong E. Coli the replication process la hai chiều (DNA vòng). Trong động vật bậc cao có phải bi-direction như thế không ạ?
Đoạn này em lấy từ wikipedia về CNV: "In certain cases, such as rapidly growing Escherichia coli cells, the gene copy number can be 4-fold greater for genes located near the origin of DNA replication, rather than at the terminus of DNA replication. Elevating the gene copy number of a particular gene can increase the expression of the protein that it encodes."
Có một vài anh bạn nói về phân tích copy number của vi khuẩn, nhưng em không đi vào chi tiết nên không biết cấu hình nó thế nào. Có thể thuật ngữ em dùng không đúng lắm. Nhưng người nói chuyện với em nhấn mạnh Ở người, CNV xảy ra phân tán khắp genome, mà em hiểu là, ví dụ gene A sẽ insert thêm vào một chỗ nào đó khác trên genome chứ không phải ngay tại vị trí của gene A. Trong thực vật thì thế nào ạ?
anh k chắc lắm là có CNV ở prokaryote vì phải tưởng tượng là genome của những loài này chỉ là 1 plasmid dạng vòng, ko có nhiều gene hoặc vùng gene lặp.
Vấn đề CNV rõ ràng hơn ở động vật và thực vật (đặc biệt trong trường hợp polyploid (>2n, có nhiều hơn 1 genome trong 1 hệ gene) .
Gần đây trong một seminar (được nghe kể lại) người ta có kết luận: copynumber variance ở người xảy ra hơi khác với prokaryote: không phải thực hiện dưới dạng tandem sequences mà thực hiện phân tán khắp genome. Recombination giữ vai trò quan trọng trong trường hợp này?
@nhân đôi: giả thuyết nghiên về cũng bi-direction nhưng nhiều vị trí khởi đầu sao chép
@vi khuẩn: a vào en:Copy-number variation thì thấy bài báo trích dẫn ko fit vào các kết luận, ko tìm thấy các bài liên quan đến topic này trên Google Scholar ngoại trừ rDNA.
@phân bố: anh nghĩ là có mối liên hệ giữa CNV và TE, repetitive element do đó phân bố sẽ phụ thuộc vào loại TE đang hoạt động. Anh nhớ 1 nhóm của viện anh đã show được việc đóng mở thay thế vai trò lẫn nhau của các nhóm TE trong quá trình phát triển của 1 NST en:B chromosome.