Lecture:Phân loại học phân tử/Nhóm 2

Từ Thư viện Khoa học VLOS
Bước tới: chuyển hướng, tìm kiếm


Danh sách học viên theo nhóm 2
 
Donatello
 2.1 Khiếu Phương LanLớp trưởng (hoạt động, nhắn tin)

 2.2 Trương Xuân Đại (hoạt động, nhắn tin)

 2.5 Lê Thị Trang (hoạt động, nhắn tin)

 2.3 Đinh Duy Thành (hoạt động, nhắn tin)

 2.4 Dương Thúy Hà (hoạt động, nhắn tin)

Portal: Giới thiệu - Nhiệm vụ - Tài liệu - Thời gian biểu - Bài tập - Blog - Giảng đường chung - Phòng họp nhóm: 1, 2, 3 - tất cả

Bản nháp của nhóm

Có 1 ý kiến nhỏ cho nhóm 2 chúng ta: thành viên trong nhóm 2 chúng ta nên để lại địa chỉ mail để tiện liên lạc theo group mail. chỉnh sửa hồ sơ 1 cách cơ bản.

Khi thao tác trên VLos có những mục khá khó về cách làm, mong mọi người viết note để những người theo sau có thể tiết kiệm được thời gian làm việc tốt nhất

Thân, Phương Lan

Bài 2,3,4

Phân tích và kết quả với các trình tự từ họ baba và blast: [[1]]

Phân tích và kết quả với các trình tự trong bộ rùa [[2]]

Khoảng cách di truyền trong loài [[3]]

Em sẽ cố gắng nộp bài tập tuần 5 sớm ạ.

Lê Thị Trang (thảo luận) 21:29, 5/6/2011 (ICT)


Bài 5

Đây là một số cây NJ mà em đã tạo ra, chắc em phải trải chúng ra sàn nhà để phân tích quá. [[4]]

Các cây này em đều bootstrap 1000

Em sử dụng file fasta (sau khi bắt cặp - cắt -bắt cặp lại - cắt -rồi bắt cặp lại tiếp - gắn lại tên loài vào trình tự) của nd4_all làm trình tự đầu vào.

@ Kiểm tra lại kcdt trong loài bằng Mega: Em sẽ gửi kết quả sau khi xử lý được trên excel.

Lê Thị Trang (thảo luận) 19:34, 8/6/2011 (ICT)

Em thử tính kcdt trong loài bằng mega (không tính đến tham số gamma): [[5]]

Cây phân loại (mô hình K80) sau khi đã nhóm các trình tự trong loài lại với nhau: [[6]]

Lê Thị Trang (thảo luận) 08:21, 17/6/2011 (ICT)


Lấy cây mà Trang tạo ra, chuyển sang dạng cây tròn, cut off 50% consensus tree


kcdt trong chi: [[7]]

kcdt giữa các chi: [[8]]

kcdt giữa Rafetus và các chi khác trong bộ rùa: [[9]]

kcdt trong họ: [[10]]

kcdt giữa các họ: [[11]]

Lê Thị Trang (thảo luận) 08:05, 20/6/2011 (ICT)

Liên kết đến đây

Xem thêm liên kết đến trang này.